До компетенції гастроентеролога входить обстеження пацієнтів з метою виявлення причини погіршення їх стану, оцінки тяжкості патології травного тракту, а також проведення лікування.
Крім того, він займається профілактикою загострень, прогресування хвороб шлунково-кишкового тракту. Він діагностує як первинну дисфункцію органів, так і вторинну, яка розвивається як ускладнення супутніх захворювань (ендокринної, нервової системи).